<InitialConditions>
<ConcentrationSet>
<!-- these apply to everything unless overridden -->
<!-- many of these are membrane molecules and should be zero except in spines and submembrane -->
<NanoMolarity specieID="ERK" value="360"/>
<NanoMolarity specieID="pERK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="ppERK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="MKP1" value="40"/>
<NanoMolarity specieID="pERKMKP1" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="ppERKMKP1" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="ppMEKERK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="ppMEKpERK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="MEK" value="680"/>
<NanoMolarity specieID="pMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="ppMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="PP2A" value="550"/>
<NanoMolarity specieID="pMEKPP2A" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="ppMEKPP2A" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="bRafRap1MEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="bRafRap1pMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="bRaf" value="300"/>
<NanoMolarity specieID="bRafRap1" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Raf1Rap1" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Rap1GTP" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Rap1GDP" value="370"/>
<NanoMolarity specieID="cAMP" value="1000"/>
<NanoMolarity specieID="buff" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="cAMPbuff" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="PDE2" value="160" />
<NanoMolarity specieID="PDE2cAMP" value="0" />
<NanoMolarity specieID="PDE2cAMP2" value="0" />
<NanoMolarity specieID="PDE4" value="100" />
<NanoMolarity specieID="PDE4cAMP" value="0" />
<NanoMolarity specieID="AMP" value="0" />
<NanoMolarity specieID="Epac" value="170"/>
<NanoMolarity specieID="EpacRap1" value="30"/>
<NanoMolarity specieID="EpacAMP" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP2" value="28"/>
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4" value="5"/>
<NanoMolarity specieID="PKA" value="1072"/>
<NanoMolarity specieID="PKAc" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="PKAr" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Src" value="20"/>
<NanoMolarity specieID="PKAcSrc" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="pSrc" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CblpSrc" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Cbl" value="500"/>
<NanoMolarity specieID="pCbl" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CRKC3G" value="500"/>
<NanoMolarity specieID="CRKC3GpCbl" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CRKC3GpCblRap1" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Rap1SynGap" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Rap1pSynGap" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="rap1Gap" value="12"/>
<NanoMolarity specieID="Rap1GTPGap" value="0" />
<NanoMolarity specieID="SynGap" value="1000"/>
<NanoMolarity specieID="pSynGap" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="pSynden" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CK" value="19410"/>
<NanoMolarity specieID="CKp" value="630"/>
<NanoMolarity specieID="CKCamCa4" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CKpCamCa4" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CKpCamCa4SynGap" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="PP1" value="2000"/>
<NanoMolarity specieID="CKpPP1" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CKpCamCa4PP1" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Ip35" value="500"/>
<NanoMolarity specieID="Ip35PP1" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Ng" value="5000"/>
<NanoMolarity specieID="NgCam" value="16000"/>
<NanoMolarity specieID="Gbg" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Gbuff" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Gbgbuff" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="SrcGbg" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Sos" value="100"/>
<NanoMolarity specieID="pSos" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Grb2" value="1000"/>
<NanoMolarity specieID="Grb2Sos" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="pShcGrb2" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="ppERKpShcGrb2Sos" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Shc" value="500"/>
<NanoMolarity specieID="pShc" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="SrcGbgShc" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="pShcGrb2Sos" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="pShcGrb2SosRas" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="RasGRF" value="200"/>
<NanoMolarity specieID="CamCa4GRF" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CamCa4GRFRas" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Raf1" value="300"/>
<NanoMolarity specieID="Raf1Ras" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="bRafRas" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="RasGTP" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="RasGDP" value="600"/>
<NanoMolarity specieID="RasSynGap" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="RaspSynGap" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="rasGap" value="10" />
<NanoMolarity specieID="RasGTPGap" value="0" />
<NanoMolarity specieID="dRaf1Ras" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="dRaf1RasMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="dRaf1RaspMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="dRaf1bRaf" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="dRaf1bRafMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="dRaf1bRafpMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="bRafRasMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="bRafRaspMEK" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Ca" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Caext" value="1e6" />
<NanoMolarity specieID="Calbin" value="145000" />
<NanoMolarity specieID="CalbinC" value="15000.0" />
<NanoMolarity specieID="CB" value="3e6"/>
<NanoMolarity specieID="CaB" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="Leak" value="700" />
<NanoMolarity specieID="CaextLeak" value="0.0" />
<NanoMolarity specieID="pmca" value="500" />
<NanoMolarity specieID="pmcaCa" value="0" />
<NanoMolarity specieID="ncx" value="2000" />
<NanoMolarity specieID="ncxCa" value="0.0" />
<!-- cytosolic molecules -->
<NanoMolarity specieID="Cam" value="12000"/>
<NanoMolarity specieID="CamCa2C" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CamCa2N" value="0"/>
<NanoMolarity specieID="CamCa4" value="10"/>
</ConcentrationSet>
<!-- number densities are in particles per cubic micron. You
get about one particles per cubic micron in a 1.6 nM solution -->
<!-- surface concentrations for membrane-bound species. The value attribute for
a PicoSD element is the number of picomoles per square metre. For comparison
with the volume concentrations, a surface density of 1 picomole/m^2, if spread
over a layer 1 micron deep, gives a 1 nanoMolar solution, so to average one
particle per square micron you need a PicoSD value of about 1.6. -->
</InitialConditions>