<InitialConditions> <ConcentrationSet region="dend"> <!-- calcium interacting proteins --> <NanoMolarity specieID="Ca" value="60"/> <!-- total calbindin = 160 uM --> <NanoMolarity specieID="Calbin" value="159980"/> <NanoMolarity specieID="CalbinC" value="20"/> <!-- total calmodulin = 9000 nM (multiple AC bound by (4/3)--> <NanoMolarity specieID="Cam" value="3785"/> <NanoMolarity specieID="CamCa2C" value="130"/> <NanoMolarity specieID="CamCa2N" value="20"/> <NanoMolarity specieID="CamCa4" value="0"/> <!-- total PP2B = 5000 nM--> <NanoMolarity specieID="PP2B" value="96" /> <NanoMolarity specieID="PP2BCam" value="3482" /> <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa2C" value="1251" /> <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa2N" value="161" /> <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa4" value="10" /> <NanoMolarity specieID="L" value="2.0"/> <NanoMolarity specieID="ATP" value="1998000.0"/> <NanoMolarity specieID="cAMP" value="89.0"/> <NanoMolarity specieID="AMP" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="Epac1cAMP" value="35.0"/> <NanoMolarity specieID="Epac1" value="1965.0"/> <!--2200 PDE4 in both size morphologies --> <NanoMolarity specieID="PDE4" value="1019.0"/> <NanoMolarity specieID="pPDE4" value="50.0"/> <NanoMolarity specieID="PKAcPDE4" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="PDE4cAMP" value="31.0"/> <NanoMolarity specieID="pPDE4cAMP" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="PKAc" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="X" value="1989.0"/> <NanoMolarity specieID="pX" value="11.0"/> <!-- total I1 = 1500, total PP1= 1500 --> <NanoMolarity specieID="I1" value="735.0"/> <NanoMolarity specieID="I1PKAc" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="Ip35" value="7.0"/> <NanoMolarity specieID="Ip35PP1" value="758.0"/> <NanoMolarity specieID="Ip35PP1PP2BCaMCa4" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="PP1" value="742.0"/> </ConcentrationSet> <SurfaceDensitySet region="dend"> <!--Gtot=3600, Rtot=600--> <PicoSD specieID="R" value="3.0"/> <PicoSD specieID="LR" value="0.0"/> <PicoSD specieID="Gs" value="2911.0"/> <PicoSD specieID="GsR" value="596.0"/> <PicoSD specieID="LRGs" value="1.0"/> <PicoSD specieID="pLRGs" value="0.0"/> <PicoSD specieID="GasGTP" value="3.0"/> <PicoSD specieID="GasGDP" value="0.0"/> <PicoSD specieID="Gbg" value="92.0"/> <PicoSD specieID="PKA" value="1234.0"/> <PicoSD specieID="PKAr" value="0.0"/> <PicoSD specieID="PKAcAMP2" value="672.0"/> <PicoSD specieID="PKAcAMP4" value="94.0"/> <!--1700 AC in small dend, 70 AC5 --> <PicoSD specieID="AC1" value="1510.0"/> <PicoSD specieID="AC1GasGTP" value="68.0"/> <PicoSD specieID="AC1CamCa4" value="7.0"/> <PicoSD specieID="AC1GasCamCa4" value="0.0"/> <PicoSD specieID="AC1CamCa4ATP" value="111.0"/> <PicoSD specieID="AC1GasCamCa4ATP" value="4.0"/> <PicoSD specieID="AC5" value="53" /> <PicoSD specieID="AC5Gas" value="2" /> <PicoSD specieID="AC5GasATP" value="15" /> </SurfaceDensitySet> </InitialConditions>