<InitialConditions> <ConcentrationSet region="dend"> <!-- calcium interacting proteins --> <NanoMolarity specieID="Ca" value="60"/> <!-- total calbindin = 160 uM --> <NanoMolarity specieID="Calbin" value="159980"/> <NanoMolarity specieID="CalbinC" value="20"/> <!-- total calmodulin = 9000 nM (divide AC bound by 3.25)--> <NanoMolarity specieID="Cam" value="3590"/> <NanoMolarity specieID="CamCa2C" value="126"/> <NanoMolarity specieID="CamCa2N" value="20"/> <NanoMolarity specieID="CamCa4" value="0"/> <!-- total PP2B = 5000 nM--> <NanoMolarity specieID="PP2B" value="96" /> <NanoMolarity specieID="PP2BCam" value="3482" /> <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa2C" value="1231" /> <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa2N" value="181" /> <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa4" value="10" /> <NanoMolarity specieID="L" value="2.0"/> <NanoMolarity specieID="ATP" value="1998000.0"/> <NanoMolarity specieID="cAMP" value="130.0"/> <NanoMolarity specieID="AMP" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="Epac1cAMP" value="35.0"/> <NanoMolarity specieID="Epac1" value="1965.0"/> <!--1100 PDE4 in both size morphologies --> <NanoMolarity specieID="PDE4" value="1052.0"/> <NanoMolarity specieID="pPDE4" value="15.0"/> <NanoMolarity specieID="PKAcPDE4" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="PDE4cAMP" value="33.0"/> <NanoMolarity specieID="pPDE4cAMP" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="PKAc" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="X" value="1992.0"/> <NanoMolarity specieID="pX" value="8.0"/> <!-- total I1 = 1500, total PP1= 1500 --> <NanoMolarity specieID="I1" value="785.0"/> <NanoMolarity specieID="I1PKAc" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="Ip35" value="7.0"/> <NanoMolarity specieID="Ip35PP1" value="708.0"/> <NanoMolarity specieID="Ip35PP1PP2BCaMCa4" value="0.0"/> <NanoMolarity specieID="PP1" value="792.0"/> </ConcentrationSet> <SurfaceDensitySet region="dend"> <!--Gtot=3600, Gs2476,Gbg528; Rtot=600--> <PicoSD specieID="R" value="4.0"/> <PicoSD specieID="LR" value="0.0"/> <PicoSD specieID="Gs" value="2934.0"/> <PicoSD specieID="GsR" value="595.0"/> <PicoSD specieID="LRGs" value="1.0"/> <PicoSD specieID="pLRGs" value="0.0"/> <PicoSD specieID="GasGTP" value="4.0"/> <PicoSD specieID="GasGDP" value="0.0"/> <PicoSD specieID="Gbg" value="70.0"/> <PicoSD specieID="PKA" value="919.0"/> <PicoSD specieID="PKAr" value="0.0"/> <PicoSD specieID="PKAcAMP2" value="870.0"/> <PicoSD specieID="PKAcAMP4" value="211.0"/> <!--7200 AC in large dend, 6294,400,28,0.452,24; 360 AC5 260,10,90 --> <PicoSD specieID="AC1" value="6680.0"/> <PicoSD specieID="AC1GasGTP" value="40.0"/> <PicoSD specieID="AC1CamCa4" value="28.0"/> <PicoSD specieID="AC1GasCamCa4" value="0.0"/> <PicoSD specieID="AC1CamCa4ATP" value="452.0"/> <PicoSD specieID="AC1GasCamCa4ATP" value="0.0"/> <PicoSD specieID="AC5" value="334" /> <PicoSD specieID="AC5Gas" value="4" /> <PicoSD specieID="AC5GasATP" value="22" /> </SurfaceDensitySet> </InitialConditions>