// Note: run these from the root model directory
{load_file("init-rgc-121203.hoc")}
elecRad = 10 // electrode radius (um)
stimZ = -40 // um
setelec(stimX, stimY, stimZ)
STIM_AMP_MIN = 0 // uA
STIM_AMP_MAX = 60 // uA
AREA_XMIN = 20 // *10 um
AREA_XMAX = 60 // *10 um
AREA_YMIN = 15 // *10 um
AREA_YMAX = 35 // *10 um
{load_file("autoThresholdMap.hoc")}
atmInit(&cell.soma.v(0.5))
atmStart("./output/axonLen-epi10.txt")
print "CHECK: Axon threshold should be lowest and smooth throughout."