#!/usr/bin/env python
"""config for neuronmodel.py"""
# _title_ : config_neuronmodel.py
# _author_ : Katharina Anna Wilmes
# _mail_ : katha __at__ bccn-berlin.de
# --Imports--
import os
import gc
import sys
import pickle
import h5py
from time import time
import numpy as np
import datetime
from NeuroTools.parameters import Parameter
params = {
'visual': 'figure',
'results_file': '',
'Neuron':
{
# morphology
'a_diam':Parameter(2),
's_diam':Parameter(18.5),
'd_diam':Parameter(2),
'd_length':Parameter(300),
'apical_length':Parameter(500),
'n_seg':Parameter(151),
# passive parameters
'R_m':Parameter(40000),
'R_a':Parameter(150),
'C_m':Parameter(0.75),
'E_leak':Parameter(-70),
'V_rest':Parameter(-70),
# active conductances
'E_Na':Parameter(60),
'E_K':Parameter(-80),
'E_Ca':Parameter(140),
'g_Na':Parameter(0.009),
'g_K':Parameter(0.01),
'g_KA':Parameter(0.029),
'slope_KA':Parameter(5),
# calcium
'gsca': Parameter(1.5,'pS/um^2'),
'git2': Parameter(0.005,'S/cm^2'),
'g_KCa': Parameter(2.5,'pS/um^2'),
'ifca': True,
# ais
'g_Na_ais':Parameter(0.3),
'g_Na_ais_shifted':Parameter(0.3),
'ifshift':True,
'dend_vshift':Parameter(-5)
},
'sim':
{
'duration' : Parameter(1,'second'),
},
}