/*
Purkinje_spine and spine neck at spinydendrite133.hoc
A hoc file for a cerebellar Purkinje neuron.
Adapted by SHERRY-ANN BROWN in "Virtual NEURON: a Strategy For Merged Biochemical and Electrophysiological Modeling"(Brown et al., 2010)
from original code written by MIYASHO Tsugumichi and MIYAKAWA Hiroyoshi.
This model runs on NEURON (version 3.2.3).
Description of the original version of this model can be found in
"Low-threshold potassium channels and a low-threshold calcium channel regulate
Ca2+ spike firing in the dendrites of cerebellar Purkinje neurons : a modeling study"(T. Miyasho et al., Brain Res 891, 2001, 106-115)
Morphology of the original cell used for the original model was taken from a paper by D.P.Shelton (Neuroscience 14, 1985, 111-131).
Channel descriptions are taken from a paper by E.De.Shutter and
J.M.Bower. (J. Neurophysiol., 71, 1994, 375-400)
*/
xopen("$(NEURONHOME)/lib/hoc/noload.hoc")
{load_proc("nrnmainmenu")}
/*
{
load_template("Inserter")
load_template("Electrode")
load_template("PointProcessManager")
load_template("PointProcessLocator")
load_template("ShowMechanism")
}
*/
NumSmoothDendrite=85
NumSpinyDendrite=1002
NumSpineNeck=1
NumSpine=1
create soma, SmoothDendrite[NumSmoothDendrite], SpinyDendrite[NumSpinyDendrite], SpineNeck[NumSpineNeck], Spine[NumSpine]
access soma
soma connect SmoothDendrite[0](0),1
soma {nseg=1 L=22 diam=22 }
SmoothDendrite[0] {nseg=1 L=18 diam=4 }
SmoothDendrite[0] connect SmoothDendrite[1](0),1
SmoothDendrite[1] {nseg=1 L=39 diam=4 }
SmoothDendrite[1] connect SmoothDendrite[2](0),1
SmoothDendrite[2] {nseg=1 L=12 diam=2 }
SmoothDendrite[2] connect SmoothDendrite[3](0),1
SmoothDendrite[3] {nseg=1 L=7 diam=2 }
SmoothDendrite[2] connect SmoothDendrite[4](0),1
SmoothDendrite[4] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[4] connect SmoothDendrite[5](0),1
SmoothDendrite[5] {nseg=1 L=10 diam=2 }
SmoothDendrite[1] connect SmoothDendrite[6](0),1
SmoothDendrite[6] {nseg=1 L=10 diam=5 }
SmoothDendrite[6] connect SmoothDendrite[7](0),1
SmoothDendrite[7] {nseg=1 L=37 diam=4 }
SmoothDendrite[7] connect SmoothDendrite[8](0),1
SmoothDendrite[8] {nseg=1 L=2 diam=4 }
SmoothDendrite[7] connect SmoothDendrite[9](0),1
SmoothDendrite[9] {nseg=1 L=15 diam=4 }
SmoothDendrite[9] connect SmoothDendrite[10](0),1
SmoothDendrite[10] {nseg=1 L=4 diam=2 }
SmoothDendrite[9] connect SmoothDendrite[11](0),1
SmoothDendrite[11] {nseg=1 L=2 diam=4 }
SmoothDendrite[11] connect SmoothDendrite[12](0),1
SmoothDendrite[12] {nseg=1 L=7 diam=4 }
SmoothDendrite[12] connect SmoothDendrite[13](0),1
SmoothDendrite[13] {nseg=1 L=2 diam=4 }
SmoothDendrite[13] connect SmoothDendrite[14](0),1
SmoothDendrite[14] {nseg=1 L=32 diam=4 }
SmoothDendrite[14] connect SmoothDendrite[15](0),1
SmoothDendrite[15] {nseg=1 L=11 diam=3 }
SmoothDendrite[17] connect SmoothDendrite[16](0),1
SmoothDendrite[16] {nseg=1 L=3 diam=2 }
SmoothDendrite[14] connect SmoothDendrite[17](0),1
SmoothDendrite[17] {nseg=1 L=3 diam=2 }
SmoothDendrite[15] connect SmoothDendrite[18](0),1
SmoothDendrite[18] {nseg=1 L=12 diam=3 }
SmoothDendrite[18] connect SmoothDendrite[19](0),1
SmoothDendrite[19] {nseg=1 L=8 diam=3 }
SmoothDendrite[19] connect SmoothDendrite[20](0),1
SmoothDendrite[20] {nseg=1 L=3 diam=2 }
SmoothDendrite[20] connect SmoothDendrite[21](0),1
SmoothDendrite[21] {nseg=1 L=6 diam=2 }
SmoothDendrite[21] connect SmoothDendrite[22](0),1
SmoothDendrite[22] {nseg=1 L=27 diam=2 }
SmoothDendrite[22] connect SmoothDendrite[23](0),1
SmoothDendrite[23] {nseg=1 L=5 diam=2 }
SmoothDendrite[23] connect SmoothDendrite[24](0),1
SmoothDendrite[24] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[6] connect SmoothDendrite[25](0),1
SmoothDendrite[25] {nseg=1 L=10 diam=5 }
SmoothDendrite[25] connect SmoothDendrite[26](0),1
SmoothDendrite[26] {nseg=1 L=12 diam=2 }
SmoothDendrite[26] connect SmoothDendrite[27](0),1
SmoothDendrite[27] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[27] connect SmoothDendrite[28](0),1
SmoothDendrite[28] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[28] connect SmoothDendrite[29](0),1
SmoothDendrite[29] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[25] connect SmoothDendrite[30](0),1
SmoothDendrite[30] {nseg=1 L=12 diam=5 }
SmoothDendrite[30] connect SmoothDendrite[31](0),1
SmoothDendrite[31] {nseg=1 L=6 diam=5 }
SmoothDendrite[31] connect SmoothDendrite[32](0),1
SmoothDendrite[32] {nseg=1 L=6 diam=2 }
SmoothDendrite[32] connect SmoothDendrite[33](0),1
SmoothDendrite[33] {nseg=1 L=13 diam=2 }
SmoothDendrite[33] connect SmoothDendrite[34](0),1
SmoothDendrite[34] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[31] connect SmoothDendrite[35](0),1
SmoothDendrite[35] {nseg=1 L=22 diam=4 }
SmoothDendrite[35] connect SmoothDendrite[36](0),1
SmoothDendrite[36] {nseg=1 L=4 diam=2 }
SmoothDendrite[35] connect SmoothDendrite[37](0),1
SmoothDendrite[37] {nseg=1 L=4 diam=4 }
SmoothDendrite[37] connect SmoothDendrite[38](0),1
SmoothDendrite[38] {nseg=1 L=20 diam=4 }
SmoothDendrite[38] connect SmoothDendrite[39](0),1
SmoothDendrite[39] {nseg=1 L=23 diam=1 }
SmoothDendrite[38] connect SmoothDendrite[40](0),1
SmoothDendrite[40] {nseg=1 L=6 diam=4 }
SmoothDendrite[40] connect SmoothDendrite[41](0),1
SmoothDendrite[41] {nseg=1 L=4 diam=4 }
SmoothDendrite[41] connect SmoothDendrite[42](0),1
SmoothDendrite[42] {nseg=1 L=1 diam=2 }
SmoothDendrite[42] connect SmoothDendrite[43](0),1
SmoothDendrite[43] {nseg=1 L=3 diam=2 }
SmoothDendrite[41] connect SmoothDendrite[44](0),1
SmoothDendrite[44] {nseg=1 L=18 diam=3 }
SmoothDendrite[44] connect SmoothDendrite[45](0),1
SmoothDendrite[45] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[45] connect SmoothDendrite[46](0),1
SmoothDendrite[46] {nseg=1 L=20 diam=2 }
SmoothDendrite[44] connect SmoothDendrite[47](0),1
SmoothDendrite[47] {nseg=1 L=8 diam=3 }
SmoothDendrite[47] connect SmoothDendrite[48](0),1
SmoothDendrite[48] {nseg=1 L=5 diam=3 }
SmoothDendrite[48] connect SmoothDendrite[49](0),1
SmoothDendrite[49] {nseg=1 L=9 diam=2 }
SmoothDendrite[49] connect SmoothDendrite[50](0),1
SmoothDendrite[50] {nseg=1 L=4 diam=2 }
SmoothDendrite[50] connect SmoothDendrite[51](0),1
SmoothDendrite[51] {nseg=1 L=6 diam=2 }
SmoothDendrite[0] connect SmoothDendrite[52](0),1
SmoothDendrite[52] {nseg=1 L=22 diam=4 }
SmoothDendrite[52] connect SmoothDendrite[53](0),1
SmoothDendrite[53] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[53] connect SmoothDendrite[54](0),1
SmoothDendrite[54] {nseg=1 L=18 diam=2 }
SmoothDendrite[52] connect SmoothDendrite[55](0),1
SmoothDendrite[55] {nseg=1 L=22 diam=6 }
SmoothDendrite[55] connect SmoothDendrite[56](0),1
SmoothDendrite[56] {nseg=1 L=8 diam=2 }
SmoothDendrite[55] connect SmoothDendrite[57](0),1
SmoothDendrite[57] {nseg=1 L=2 diam=6 }
SmoothDendrite[57] connect SmoothDendrite[58](0),1
SmoothDendrite[58] {nseg=1 L=3 diam=5 }
SmoothDendrite[58] connect SmoothDendrite[59](0),1
SmoothDendrite[59] {nseg=1 L=3 diam=6 }
SmoothDendrite[59] connect SmoothDendrite[60](0),1
SmoothDendrite[60] {nseg=1 L=8 diam=2 }
SmoothDendrite[59] connect SmoothDendrite[61](0),1
SmoothDendrite[61] {nseg=1 L=14 diam=6 }
SmoothDendrite[61] connect SmoothDendrite[62](0),1
SmoothDendrite[62] {nseg=1 L=44 diam=2 }
SmoothDendrite[62] connect SmoothDendrite[63](0),1
SmoothDendrite[63] {nseg=1 L=12 diam=2 }
SmoothDendrite[63] connect SmoothDendrite[64](0),1
SmoothDendrite[64] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[62] connect SmoothDendrite[65](0),1
SmoothDendrite[65] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[65] connect SmoothDendrite[66](0),1
SmoothDendrite[66] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[66] connect SmoothDendrite[67](0),1
SmoothDendrite[67] {nseg=1 L=13 diam=1 }
SmoothDendrite[67] connect SmoothDendrite[68](0),1
SmoothDendrite[68] {nseg=1 L=4 diam=1 }
SmoothDendrite[61] connect SmoothDendrite[69](0),1
SmoothDendrite[69] {nseg=1 L=10 diam=6 }
SmoothDendrite[69] connect SmoothDendrite[70](0),1
SmoothDendrite[70] {nseg=1 L=4 diam=3 }
SmoothDendrite[70] connect SmoothDendrite[71](0),1
SmoothDendrite[71] {nseg=1 L=4 diam=3 }
SmoothDendrite[69] connect SmoothDendrite[72](0),1
SmoothDendrite[72] {nseg=1 L=2 diam=6 }
SmoothDendrite[72] connect SmoothDendrite[73](0),1
SmoothDendrite[73] {nseg=1 L=24 diam=5 }
SmoothDendrite[73] connect SmoothDendrite[74](0),1
SmoothDendrite[74] {nseg=1 L=52 diam=2 }
SmoothDendrite[74] connect SmoothDendrite[75](0),1
SmoothDendrite[75] {nseg=1 L=16 diam=2 }
SmoothDendrite[73] connect SmoothDendrite[76](0),1
SmoothDendrite[76] {nseg=1 L=14 diam=4 }
SmoothDendrite[76] connect SmoothDendrite[77](0),1
SmoothDendrite[77] {nseg=1 L=2 diam=4 }
SmoothDendrite[77] connect SmoothDendrite[78](0),1
SmoothDendrite[78] {nseg=1 L=14 diam=4 }
SmoothDendrite[78] connect SmoothDendrite[79](0),1
SmoothDendrite[79] {nseg=1 L=24 diam=4 }
SmoothDendrite[79] connect SmoothDendrite[80](0),1
SmoothDendrite[80] {nseg=1 L=6 diam=2 }
SmoothDendrite[79] connect SmoothDendrite[81](0),1
SmoothDendrite[81] {nseg=1 L=8 diam=2 }
SmoothDendrite[81] connect SmoothDendrite[82](0),1
SmoothDendrite[82] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SmoothDendrite[82] connect SmoothDendrite[83](0),1
SmoothDendrite[83] {nseg=1 L=6 diam=2 }
SmoothDendrite[83] connect SmoothDendrite[84](0),1
SmoothDendrite[84] {nseg=1 L=12 diam=2 }
soma {cm=0.8
insert Leak gl_Leak = 0.00006 el_Leak = -80
insert NaF gnabar_NaF = 10
insert NaP
insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.0005
insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaT = 0
insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaE = 0
insert Khh
insert KM
insert KA
insert KD gkbar_KD = 0
insert Kh gkbar_Kh = 0.0005
insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5
}
for i=0,84 SmoothDendrite[i] {cm=0.8
insert Leak gl_Leak = 0.00021 el_Leak = -80
insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.004
insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaT = 0.0015
insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaE = 0.008
insert Khh gkbar_Khh = 0.0006
insert KM gkbar_KM = 0.00001
insert KA gkbar_KA = 0.08
insert KD gkbar_KD = 0.09
insert KC3 gkbar_KC3 = 0.06
insert K23
insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5
}
/**** Spiny 1 ****/
SmoothDendrite[53] connect SpinyDendrite[0](0),1
SpinyDendrite[0] {nseg=1 L=8 diam=1 }
/**** Spiny 2 ****/
SmoothDendrite[54] connect SpinyDendrite[1](0),1
SpinyDendrite[1] {nseg=1 L=9 diam=2 }
SpinyDendrite[1] connect SpinyDendrite[2](0),1
SpinyDendrite[2] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
SpinyDendrite[2] connect SpinyDendrite[3](0),1
SpinyDendrite[3] {nseg=1 L=8 diam=1 }
SpinyDendrite[2] connect SpinyDendrite[4](0),1
SpinyDendrite[4] {nseg=1 L=10 diam=1 }
SpinyDendrite[1] connect SpinyDendrite[5](0),1
SpinyDendrite[5] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
SpinyDendrite[5] connect SpinyDendrite[6](0),1
SpinyDendrite[6] {nseg=1 L=5 diam=1.0 }
SpinyDendrite[5] connect SpinyDendrite[7](0),1
SpinyDendrite[7] {nseg=1 L=9 diam=1.0 }
/**** Spiny 3 ****/
SmoothDendrite[54] connect SpinyDendrite[8](0),1
SpinyDendrite[8] {nseg=1 L=4 diam=2 }
SpinyDendrite[8] connect SpinyDendrite[9](0),1
SpinyDendrite[9] {nseg=1 L=9 diam=1.0 }
SpinyDendrite[8] connect SpinyDendrite[10](0),1
SpinyDendrite[10] {nseg=1 L=5 diam=2.0 }
SpinyDendrite[10] connect SpinyDendrite[11](0),1
SpinyDendrite[11] {nseg=1 L=10 diam=1.0 }
SpinyDendrite[10] connect SpinyDendrite[12](0),1
SpinyDendrite[12] {nseg=1 L=2 diam=2.0 }
SpinyDendrite[12] connect SpinyDendrite[13](0),1
SpinyDendrite[13] {nseg=1 L=13 diam=1.4 }
SpinyDendrite[13] connect SpinyDendrite[14](0),1
SpinyDendrite[14] {nseg=1 L=7 diam=1.0 }
SpinyDendrite[13] connect SpinyDendrite[15](0),1
SpinyDendrite[15] {nseg=1 L=6 diam=1 }
SpinyDendrite[12] connect SpinyDendrite[16](0),1
SpinyDendrite[16] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
SpinyDendrite[16] connect SpinyDendrite[17](0),1
SpinyDendrite[17] {nseg=1 L=10 diam=1 }
SpinyDendrite[16] connect SpinyDendrite[18](0),1
SpinyDendrite[18] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
SpinyDendrite[18] connect SpinyDendrite[19](0),1
SpinyDendrite[19] {nseg=1 L=3 diam=1 }
SpinyDendrite[18] connect SpinyDendrite[20](0),1
SpinyDendrite[20] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
SpinyDendrite[20] connect SpinyDendrite[21](0),1
SpinyDendrite[21] {nseg=1 L=5 diam=1 }
SpinyDendrite[20] connect SpinyDendrite[22](0),1
SpinyDendrite[22] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }
SpinyDendrite[22] connect SpinyDendrite[23](0),1
SpinyDendrite[23] {nseg=1 L=8 diam=1 }
SpinyDendrite[22] connect SpinyDendrite[24](0),1
SpinyDendrite[24] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
SpinyDendrite[24] connect SpinyDendrite[25](0),1
SpinyDendrite[25] {nseg=1 L=2 diam=1 }
SpinyDendrite[24] connect SpinyDendrite[26](0),1
SpinyDendrite[26] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
SpinyDendrite[26] connect SpinyDendrite[27](0),1
SpinyDendrite[27] {nseg=1 L=5 diam=1 }
SpinyDendrite[26] connect SpinyDendrite[28](0),1
SpinyDendrite[28] {nseg=1 L=4 diam=1 }
/**** Spiny 4 ****/
SmoothDendrite[56] connect SpinyDendrite[29](0),1
SpinyDendrite[29] {nseg=1 L=11 diam=2 }
SpinyDendrite[29] connect SpinyDendrite[30](0),1
SpinyDendrite[30] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
SpinyDendrite[30] connect SpinyDendrite[31](0),1
SpinyDendrite[31] {nseg=1 L=10 diam=1 }
SpinyDendrite[30] connect SpinyDendrite[32](0),1
SpinyDendrite[32] {nseg=1 L=10 diam=1 }
SpinyDendrite[29] connect SpinyDendrite[33](0),1
SpinyDendrite[33] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SpinyDendrite[33] connect SpinyDendrite[34](0),1
SpinyDendrite[34] {nseg=1 L=18 diam=1 }
SpinyDendrite[33] connect SpinyDendrite[35](0),1
SpinyDendrite[35] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SpinyDendrite[35] connect SpinyDendrite[36](0),1
SpinyDendrite[36] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
SpinyDendrite[36] connect SpinyDendrite[37](0),1
SpinyDendrite[37] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
SpinyDendrite[37] connect SpinyDendrite[38](0),1
SpinyDendrite[38] {nseg=1 L=18 diam=1 }
SpinyDendrite[37] connect SpinyDendrite[39](0),1
SpinyDendrite[39] {nseg=1 L=6 diam=1 }
SpinyDendrite[36] connect SpinyDendrite[40](0),1
SpinyDendrite[40] {nseg=1 L=7 diam=1 }
SpinyDendrite[35] connect SpinyDendrite[41](0),1
SpinyDendrite[41] {nseg=1 L=6 diam=2 }
SpinyDendrite[41] connect SpinyDendrite[42](0),1
SpinyDendrite[42] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
SpinyDendrite[42] connect SpinyDendrite[43](0),1
SpinyDendrite[43] {nseg=1 L=6 diam=1 }
SpinyDendrite[42] connect SpinyDendrite[44](0),1
SpinyDendrite[44] {nseg=1 L=6 diam=1 }
SpinyDendrite[41] connect SpinyDendrite[45](0),1
SpinyDendrite[45] {nseg=1 L=7 diam=1.4 }
SpinyDendrite[45] connect SpinyDendrite[46](0),1
SpinyDendrite[46] {nseg=1 L=8 diam=1 }
SpinyDendrite[45] connect SpinyDendrite[47](0),1
SpinyDendrite[47] {nseg=1 L=7 diam=1.4 }
SpinyDendrite[46] connect SpinyDendrite[48](0),1
SpinyDendrite[48] {nseg=1 L=3 diam=1 }
SpinyDendrite[47] connect SpinyDendrite[49](0),1
SpinyDendrite[49] {nseg=1 L=6 diam=1 }
/**** Spiny 5 ****/
SmoothDendrite[56] connect SpinyDendrite[50](0),1
SpinyDendrite[50] {nseg=1 L=5 diam=2 }
SpinyDendrite[50] connect SpinyDendrite[51](0),1
SpinyDendrite[51] {nseg=1 L=17 diam=1 }
SpinyDendrite[50] connect SpinyDendrite[52](0),1
SpinyDendrite[52] {nseg=1 L=4 diam=2 }
SpinyDendrite[52] connect SpinyDendrite[53](0),1
SpinyDendrite[53] {nseg=1 L=16 diam=1.4 }
SpinyDendrite[53] connect SpinyDendrite[54](0),1
SpinyDendrite[54] {nseg=1 L=15 diam=1}
SpinyDendrite[53] connect SpinyDendrite[55](0),1
SpinyDendrite[55] {nseg=1 L=3 diam=1 }
SpinyDendrite[52] connect SpinyDendrite[56](0),1
SpinyDendrite[56] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
SpinyDendrite[56] connect SpinyDendrite[57](0),1
SpinyDendrite[57] {nseg=1 L=4 diam=1 }
SpinyDendrite[56] connect SpinyDendrite[58](0),1
SpinyDendrite[58] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
SpinyDendrite[58] connect SpinyDendrite[59](0),1
SpinyDendrite[59] {nseg=1 L=4 diam=1 }
SpinyDendrite[58] connect SpinyDendrite[60](0),1
SpinyDendrite[60] {nseg=1 L=9 diam=1.4 }
SpinyDendrite[60] connect SpinyDendrite[61](0),1
SpinyDendrite[61] {nseg=1 L=14 diam=1 }
SpinyDendrite[60] connect SpinyDendrite[62](0),1
SpinyDendrite[62] {nseg=1 L=7 diam=1 }
/**** Spiny 6 ****/
SmoothDendrite[57] connect SpinyDendrite[63](0),1
SpinyDendrite[63] {nseg=1 L=16 diam=1.4 }
SpinyDendrite[63] connect SpinyDendrite[64](0),1
SpinyDendrite[64] {nseg=1 L=4 diam=1 }
SpinyDendrite[63] connect SpinyDendrite[65](0),1
SpinyDendrite[65] {nseg=1 L=18 diam=1 }
/**** Spiny 7 ****/
SmoothDendrite[58] connect SpinyDendrite[66](0),1
SpinyDendrite[66] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
SpinyDendrite[66] connect SpinyDendrite[67](0),1
SpinyDendrite[67] {nseg=1 L=6 diam=1 }
SpinyDendrite[66] connect SpinyDendrite[68](0),1
SpinyDendrite[68] {nseg=1 L=29 diam=1 }
/**** Spiny 8 ****/
SmoothDendrite[70] connect SpinyDendrite[69](0),1
SpinyDendrite[69] {nseg=1 L=11 diam=1.4 }
SpinyDendrite[69] connect SpinyDendrite[70](0),1
SpinyDendrite[70] {nseg=1 L=12 diam=1 }
SpinyDendrite[69] connect SpinyDendrite[71](0),1
SpinyDendrite[71] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }
SpinyDendrite[71] connect SpinyDendrite[72](0),1
SpinyDendrite[72] {nseg=1 L=12 diam=1 }
SpinyDendrite[71] connect SpinyDendrite[73](0),1
SpinyDendrite[73] {nseg=1 L=9 diam=1 }
/**** Spiny 9 ****/
SmoothDendrite[71] connect SpinyDendrite[74](0),1
SpinyDendrite[74] {nseg=1 L=2 diam=2 }
SpinyDendrite[74] connect SpinyDendrite[75](0),1
SpinyDendrite[75] {nseg=1 L=22 diam=1.4 }
SpinyDendrite[75] connect SpinyDendrite[76](0),1
SpinyDendrite[76] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
SpinyDendrite[76] connect SpinyDendrite[77](0),1
SpinyDendrite[77] {nseg=1 L=14 diam=1 }
SpinyDendrite[76] connect SpinyDendrite[78](0),1
SpinyDendrite[78] {nseg=1 L=8 diam=1 }
SpinyDendrite[75] connect SpinyDendrite[79](0),1
SpinyDendrite[79] {nseg=1 L=10 diam=1 }
SpinyDendrite[74] connect SpinyDendrite[80](0),1
SpinyDendrite[80] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
SpinyDendrite[80] connect SpinyDendrite[81](0),1
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/**** Spiny 10 ****/
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/**** Spiny 11 ****/
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/**** Spiny 12 ****/
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SpineNeck {nseg=1 L=0.66 diam=0.2 }
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Spine {nseg=1 L=0.57 diam=0.57 }
/**** Spiny 13 ****/
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/**** Spiny 14 ****/
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/**** Spiny 15 ****/
SmoothDendrite[80] connect SpinyDendrite[160](0),1
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/**** Spiny 16 ****/
SmoothDendrite[81] connect SpinyDendrite[173](0),1
SpinyDendrite[173] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
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/**** Spiny 17 ****/
SmoothDendrite[84] connect SpinyDendrite[176](0),1
SpinyDendrite[176] {nseg=1 L=8 diam=2 }
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/**** Spiny 18 ****/
SmoothDendrite[84] connect SpinyDendrite[189](0),1
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/**** Spiny 19 ****/
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/**** Spiny 20 ****/
SmoothDendrite[82] connect SpinyDendrite[203](0),1
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/**** Spiny 21 ****/
SmoothDendrite[76] connect SpinyDendrite[208](0),1
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SpinyDendrite[212] connect SpinyDendrite[214](0),1
SpinyDendrite[214] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
SpinyDendrite[214] connect SpinyDendrite[215](0),1
SpinyDendrite[215] {nseg=1 L=3 diam=1}
SpinyDendrite[214] connect SpinyDendrite[216](0),1
SpinyDendrite[216] {nseg=1 L=6 diam=1}
/**** Spiny 22 ****/
SmoothDendrite[75] connect SpinyDendrite[217](0),1
SpinyDendrite[217] {nseg=1 L=4 diam=2 }
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SpinyDendrite[219] {nseg=1 L=13 diam=1.4 }
SpinyDendrite[219] connect SpinyDendrite[220](0),1
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SpinyDendrite[222] {nseg=1 L=6 diam=1}
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SpinyDendrite[223] {nseg=1 L=10 diam=1}
SpinyDendrite[219] connect SpinyDendrite[224](0),1
SpinyDendrite[224] {nseg=1 L=5 diam=1}
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/**** Spiny 23 ****/
SmoothDendrite[75] connect SpinyDendrite[238](0),1
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SpinyDendrite[246] {nseg=1 L=5 diam=1 }
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/**** Spiny 86 ****/
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for i=0,1001 SpinyDendrite[i] {cm=1.5
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}
Spine {cm=0.8
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insert KC3 gkbar_KC3 = 0.06
insert K23
insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5
}
global_ra = 250
set_ra()
celsius = 37
nrnmainmenu() /* shows the main panel window on the screen */