<InitialConditions>
<!-- these apply to everything unless overridden -->
<ConcentrationSet>
<NanoMolarity specieID="Ca" value=" 58.669" />
<NanoMolarity specieID="CaOut" value="2005230.1" />
<NanoMolarity specieID="Calbin" value="145508.28" />
<NanoMolarity specieID="CalbinCa" value=" 14328.99" />
<NanoMolarity specieID="pmca" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="pmcaCa" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="ncx" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="ncxCa" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="LOut" value="1000000.4" />
<NanoMolarity specieID="L" value=" 10.00" />
<NanoMolarity specieID="R" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="G" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="LRG" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="LR" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GR" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GaGTP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GaGDP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="LRGbg" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Gbg" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="AC" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="ACGaGTP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="ACGaGTPCa" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="ATP" value="1998350.8" />
<NanoMolarity specieID="ACGaGTPCaATP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="ACGaGTPATP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="cAMP" value=" 35.645" />
<NanoMolarity specieID="ACCa" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PDE1" value=" 3125.355" />
<NanoMolarity specieID="PDE1CamCa4" value=" 855.46" />
<NanoMolarity specieID="PDE1CamCa4cAMP" value=" 0" />
<!-- <NanoMolarity specieID="PDE10" value=" 800.614" />
<NanoMolarity specieID="PDE10cAMP" value=" 118.275" />
<NanoMolarity specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcPDE10cAMP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4PDE10" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="pPDE10" value=" 364.308" />
<NanoMolarity specieID="pPDE10cAMP" value=" 34.024" />-->
<NanoMolarity specieID="AMP" value=" 605.952" />
<NanoMolarity specieID="CamCa2" value=" 341.861" />
<NanoMolarity specieID="CamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Cam" value=" 4921.5" />
<NanoMolarity specieID="PP2B" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PP2BCam" value=" 2359.189" />
<NanoMolarity specieID="PP2BCamCa2" value=" 1218.378" />
<NanoMolarity specieID="PP2BCamCa4" value=" 8.101" />
<NanoMolarity specieID="CK" value=" 11318.40" />
<NanoMolarity specieID="CKCamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="CKpCamCa4" value=" 140" />
<NanoMolarity specieID="CKp" value=" 500.0" />
<NanoMolarity specieID="Complex" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="pComplex" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="CKpPP1" value=" 242.683" />
<NanoMolarity specieID="CKpCamCa4PP1" value=" 8.101" />
<NanoMolarity specieID="PP1" value=" 3750.0" />
<!-- <NanoMolarity specieID="PKA" value=" 1000" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP2" value=" 160" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4" value=" 25.000" />
<NanoMolarity specieID="R2C_cAMP4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAc" value=" 50.000" />
<NanoMolarity specieID="PKAr" value=" 25.000" /> -->
<NanoMolarity specieID="PP2A_BPR72" value=" 800.000" />
<NanoMolarity specieID="PP2A_B56d" value=" 630.000" />
<NanoMolarity specieID="PP1PP2BCamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="D32" value=" 36400.00" />
<NanoMolarity specieID="D32PKA" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="D32PKAcAMP4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Dp34" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Dp34PP1" value=" 650.0" />
<NanoMolarity specieID="Dp34PP2BCamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Dp34PP1PP2BCamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Dp34PP2A_BPR72" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Dp34PP2A_B56d" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PP1PP2A_BPR72" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PP1PP2A_B56d" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Dp34PP1PP2A_BPR72" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Dp34PP1PP2A_B56d" value=" 11.342" />
<NanoMolarity specieID="Cdk5" value=" 1088.581" />
<NanoMolarity specieID="CDK5D32" value=" 2057.652" />
<NanoMolarity specieID="Dp75" value="10362.917" />
<NanoMolarity specieID="PKAi" value=" 08" />
<NanoMolarity specieID="Dp75PP2A_BPR72" value=" 200.000" />
<NanoMolarity specieID="Dp75PP2A_B56d" value=" 200.000" />
<NanoMolarity specieID="Dp75PPaC" value=" 25.000" />
<NanoMolarity specieID="Dp75PPAP" value=" 120.000" />
<NanoMolarity specieID="PKAcPP2A_B56d" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4PP2A_B56d" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PP2AP" value=" 140.000" />
<NanoMolarity specieID="PP2AC" value=" 33.000" />
</ConcentrationSet>
<!--
********************************************************************
This is the block of SurfaceDensitySet applied to the dend region.
********************************************************************
-->
<SurfaceDensitySet region="dend1">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
<PicoSD specieID="pmcaCa" value=" 28.25" />
<PicoSD specieID="ncx" value=" 2994.17" />
<PicoSD specieID="ncxCa" value=" 213.72" />
<PicoSD specieID="PDE10" value=" 292.500" />
<PicoSD specieID="PDE10cAMP" value=" 49.247" />
<PicoSD specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
<PicoSD specieID="PKAcPDE10cAMP" value=" 0" />
<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10" value=" 0" />
<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<PicoSD specieID="pPDE10" value=" 49.817" />
<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend1a">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
<PicoSD specieID="pmcaCa" value=" 28.25" />
<PicoSD specieID="ncx" value=" 2994.17" />
<PicoSD specieID="ncxCa" value=" 213.72" />
<PicoSD specieID="PDE10" value=" 292.500" />
<PicoSD specieID="PDE10cAMP" value=" 49.247" />
<PicoSD specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
<PicoSD specieID="PKAcPDE10cAMP" value=" 0" />
<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10" value=" 0" />
<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<PicoSD specieID="pPDE10" value=" 49.817" />
<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend2">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
<PicoSD specieID="pmcaCa" value=" 28.25" />
<PicoSD specieID="ncx" value=" 2994.17" />
<PicoSD specieID="ncxCa" value=" 213.72" />
<PicoSD specieID="PDE10" value=" 292.500" />
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<PicoSD specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
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<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<PicoSD specieID="pPDE10" value=" 49.817" />
<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend3">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
<PicoSD specieID="pmcaCa" value=" 28.25" />
<PicoSD specieID="ncx" value=" 2994.17" />
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<PicoSD specieID="PDE10" value=" 292.500" />
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<PicoSD specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
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<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<PicoSD specieID="pPDE10" value=" 49.817" />
<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend3a">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
<PicoSD specieID="pmcaCa" value=" 28.25" />
<PicoSD specieID="ncx" value=" 2994.17" />
<PicoSD specieID="ncxCa" value=" 213.72" />
<PicoSD specieID="PDE10" value=" 292.500" />
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<PicoSD specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
<PicoSD specieID="PKAcPDE10cAMP" value=" 0" />
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<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<PicoSD specieID="pPDE10" value=" 49.817" />
<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend4">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
<PicoSD specieID="pmcaCa" value=" 28.25" />
<PicoSD specieID="ncx" value=" 2994.17" />
<PicoSD specieID="ncxCa" value=" 213.72" />
<PicoSD specieID="PDE10" value=" 292.500" />
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<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<PicoSD specieID="pPDE10" value=" 49.817" />
<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend4a">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
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<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend5">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
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<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend6">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
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<PicoSD specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
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<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend6a">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
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<PicoSD specieID="ncx" value=" 2994.17" />
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<PicoSD specieID="PDE10" value=" 292.500" />
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<PicoSD specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
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</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend7">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
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</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend7a">
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</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend8">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
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</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend9">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
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</SurfaceDensitySet>
<SurfaceDensitySet region="dend9a">
<PicoSD specieID="pmca" value=" 86.82" />
<PicoSD specieID="pmcaCa" value=" 28.25" />
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<PicoSD specieID="pPDE10" value=" 49.817" />
<PicoSD specieID="pPDE10cAMP" value=" 10.897" />
</SurfaceDensitySet>
<ConcentrationSet region="neck">
<NanoMolarity specieID="pmca" value=" 297.765" />
<NanoMolarity specieID="pmcaCa" value=" 96.909" />
<NanoMolarity specieID="ncx" value=" 10268.46" />
<NanoMolarity specieID="ncxCa" value=" 732.961" />
<NanoMolarity specieID="PDE10" value=" 2500.00" />
<NanoMolarity specieID="PDE10cAMP" value=" 150.00" />
<NanoMolarity specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcPDE10cAMP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4PDE10" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="pPDE10" value=" 550.00" />
<NanoMolarity specieID="pPDE10cAMP" value=" 100.00" />
</ConcentrationSet>
<ConcentrationSet region="head">
<NanoMolarity specieID="R" value=" 153.90" />
<NanoMolarity specieID="G" value=" 8158.32" />
<NanoMolarity specieID="LRG" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="LR" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GR" value=" 1255.50" />
<NanoMolarity specieID="GaGTP" value=" 8.10" />
<NanoMolarity specieID="GaGDP" value=" 90.00" />
<NanoMolarity specieID="LRGbg" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="Gbg" value=" 43.20" />
<NanoMolarity specieID="AC" value=" 7428.00" />
<NanoMolarity specieID="ACGaGTP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="ACGaGTPCa" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="ACGaGTPCaATP" value=" 14.04" />
<NanoMolarity specieID="ACGaGTPATP" value=" 114.48" />
<NanoMolarity specieID="ACCa" value=" 2376.00" />
<NanoMolarity specieID="PKA" value=" 7050.00" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP2" value=" 925.00" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4" value=" 137.50" />
<NanoMolarity specieID="R2C_cAMP4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAc" value=" 220.0" />
<NanoMolarity specieID="PKAr" value=" 150.0" />
<NanoMolarity specieID="PDE10" value=" 2500.00" />
<NanoMolarity specieID="PDE10cAMP" value=" 150.00" />
<NanoMolarity specieID="PKAcPDE10" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcPDE10cAMP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4PDE10" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4PDE10cAMP" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="pPDE10" value=" 550.00" />
<NanoMolarity specieID="pPDE10cAMP" value=" 100.00" />
</ConcentrationSet>
<ConcentrationSet region="PSD">
<NanoMolarity specieID="PKA" value=" 7050.00" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP2" value=" 925.00" />
<NanoMolarity specieID="PKAcAMP4" value=" 137.50" />
<NanoMolarity specieID="R2C_cAMP4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="PKAc" value=" 220.0" />
<NanoMolarity specieID="PKAr" value=" 150.0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1" value=" 8050.7" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845" value=" 243.96" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S831" value=" 853.86" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845_S831" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_PKAc" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_PKAcAMP4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S831_PKAc" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S831_PKAcAMP4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_CKCamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_CKpCamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_CKp" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845_CKCamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845_CKpCamCa4" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845_CKp" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845_PP1" value=" 365.94" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845_S831_PP1" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S831_PP1" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845_PP2B" value=" 0" />
<NanoMolarity specieID="GluR1_S845_S831_PP2B" value=" 0" />
</ConcentrationSet>
<!-- number densities are in particles per cubic micron. You
get about one particles per cubic micron in a 1.6 nM solution -->
<!-- surface concentrations for membrane-bound species. The value attribute for
a PicoSD element is the number of picomoles per square metre. For comparison
with the volume concentrations, a surface density of 1 picomole/m^2, if spread
over a layer 1 micron deep, gives a 1 nanoMolar solution, so to average one
particle per square micron you need a PicoSD value of about 1.6. -->
<!-- <SurfaceDensitySet region="dendrite">
<PicoSD specieID="GaGTP" value="003.729" />
<PicoSD specieID="AC" value="2.521e+04" />
</SurfaceDensitySet>-->
</InitialConditions>